루팅폰은 xposed 모듈 마켓업데이트 방지 어플로 가능합니다.
자세한 사용법은 구글 검색 마켓업데이트 방지 하면 나옵니다.

루팅을 안하신 상태면 다른 방법이 있습니다
현재 업데이트를 안하신 상태이시죠

앱APK를 수정해서 다시 설치하는 방법인데요
원리를 말씀드리면
모든 앱은 그 앱 개발자의 디지털 서명이 들어갑니다
그 서명으로 구글플레이의 올라가있는 오리지널 앱과 같은 개발자가 만들었는지 확인하게 됩니다
앱APK를 구해서 그앱의 서명을 다른 서명으로 바꾸고 다시 설치하면
구글플레이에 있는 앱과 서명이 다르기 때문에 업그레이드 버튼이 안뜨게되는거죠

방법은 이렇습니다
일단 APK를 구해야 되는데 업그레이드를 안하신 상태인걸로 보이니
앱을 백업하면 APK를 추출할수 있게 됩니다(루팅없이 가능)
es explorer를 예로 들면 라이브러리 > APP 에 목록에서 앱선택후 길게 누르고
위에 뜨는 아이콘 중에 백업 아이콘이 있습니다 누르면 백업이 되는데
백업된 앱은 sdcard/backups/apps 에 있을겁니다
위의 예는 그냥 APK를 백업하는 예를 들어 설명해드린거고 다른 백업앱을 쓰셔도 됩니다

그리고 백업된 앱을 다시 서명해야겠죠 서명앱은 여러가지 있는데
이번에는 zipsigner(구글플레이서 받을수 있음)를 예로 들어드릴게요
앱을 받아 실행하면 간단한 화면이 나옵니다
INPUT, OUTPUT, 그리고 서명 선택박스 그리고 서명하기 버튼이 있는데요
말그대로 input에 원본 apk를 선택하시고 output에 수정된 apk가 나올 경로와 파일명을 선택할수 있습니다
제일 중요한 밑에 서명 방식인데요
auto-none과 none은 변하는게 없습니다 선택하지 마시고
auto는 서명에서 에러가 날거고 platform은 설치에서 에러가 날거 같고 그외에 나머지 아무거나 하셔도 될겁니다
대충 auto-testkey를 선택하시고 밑에 박스 누르면 재서명을 하게 됩니다
output에 지정됐던 위치로 가셔서 새로운 apk가 나왔으면 그 apk로 설치하시면 끝입니다
(여기서 아마 휴대폰 보안 설정에서 \'알수 없는 소스\' 설치를 꺼놓으셨으면 켜야 할겁니다.
아무것도 안만지고도 그냥 설치가 된다면 신경안쓰셔도 됩니다)
그리고 설치하기전에 그전에 설치되있던 앱은 제거를 하시구요

이제 구글플레이 가서 확인해보시면 업데이트 목록에 안뜬걸 확인할수 있을겁니다

마지막으로 앱자체에서 실행시에 서명을 체크하거나 하는 경우가 있습니다
실행이 안될수도 있는데요 서울 버스 앱은 어떨지 모르겠네요
시험삼아 현재의 카카오 버스 앱을 받아서 테스트 해봤는데
다른 메뉴는 정상 사용가능한데 카카오 계정 로그인 메뉴는 사용이 불가하네요
서명을 체크하는거 같습니다
하지만 질문자께서는 예전 서울 버스앱을 말씀하시는 거니 정상 사용이 가능할듯 싶습니다